近年来人体肠路微生物组成为了钻延装新宠”
，那么人体内的病毒
，噬菌体呢？
在一项初次针对泌尿系统病毒组的钻研中
，钻研人员发现了数百种病毒
，其中大部门病毒之前从未被测序过
。

我们人体中的病毒会影响微生物群体的结构和行为
，但是关于身段很多区域的噬菌体
，也就是习染细菌的病毒
，科学家们所知甚少
。近期一组钻研人员发现
，在膀胱中整合进细菌基因组的是噬菌体要比细菌自身多得多
，这项出乎人意料的钻研发现颁布在1月29日的the  Journal of Bacteriology杂志上
。

“由于病毒组的钻研很难题
，因而我们对我们体内的病毒
，以及它们与健全
，疾病的关联知之甚少
。为了添补这方面的知识空缺
，做这些钻研是极度沉要的
，”英国曼彻斯特大学的医学微生物学家Chloe  James（未参加该项钻研）以为
。

钻研的起头

这项钻研起头于芝加哥洛约拉大学（Loyola University）的生物信息学家Catherine  Putonti
，她为了援手她的同事分析来自181位女性患者膀胱中网络到的序列数据
，这些患者存在或不存在泌尿系统问题
。她从中发现了了很多病毒
，由此她感触对这些病毒序列发展深刻的探求
。

Putonti说：“膀胱里有细菌
，但也不是好多
，因而我想‘若是没有那么多细菌
，那么也许就没有多的病毒了’
，但是让我吃惊的是
，存在极度多的噬菌体
。”

钻研人员在他们钻研的200个细菌基因组中鉴定出大部门细菌都有的450多种可能的噬菌体序列
。超过一半的这些病毒序列从未呈此刻任何数据库中过
，这批注它们可能是泌尿路特有的噬菌体
。

“这些噬菌体一次又一次地出现
，”James说
，“在所有的微环境中
，每次针对病毒群体的测序
，提及的噬菌体都很少
，这次发现了这么多噬菌体
，这批注我们不知路的事件还好多
。”

钻研人员发现来自分歧女性的噬菌体序列拥有类似性
，这批注可能存在膀胱噬菌体
。同时他们也发现了泌尿系统存在或者不存在问题女性样本之间噬菌体群体的一些变动
，这些问题蕴含膀胱过度活动
，失禁
，膀胱疼痛和尿路习染
。

为了确定他们发现的噬菌体序列是否齐全
，能否习染细菌
，钻研人员对纯化后的噬菌体进行了电子显微检测
，分析它们是否能分化造就皿中的细菌
。了局批注
，固然病毒是整合到宿主基因组中
，但它们依然可能杀死其它细菌
，这批注这些是职能性噬菌体
。

西方大学人类微生物生态学家
，Jeremy  Burton（未参加这项工作）说
，“此前还没有人齐全描述过膀胱中的噬菌体
，”但他也提醒说
，由于作者检测的是尝试室中成长的细菌的基因组
，因而可能错失了一些整合到难以造就的细菌基因组中的噬菌体
。不外总体来说
，“这是一篇极度好的论文
，”他说
。

由于增长了造就这一步骤
，的确可能迷失了一些噬菌体
，James说
，”但这些发现更有意思了
，由于它们能够将噬菌体序列与细菌宿主关联在一路
。很多病毒组钻研面对的挑战在于找到正确的易感宿主
，以便能造就噬菌体并发显熹职能性作用
。”
Putonti钻研幼组已经在从膀胱细菌中分离出了更多的噬菌体
，并与临床医生合作
，确定这些噬菌体是否在尿路疾病中阐扬作用
。

“钻研人员发现了微生物微环境中病毒群体所造成的潜在影响
，这一点极度好
。在我们真正起头相识其作用之前
，我们必要明显这里到底有什么
，“”华盛顿大学医学院人体微生物和病毒组钻研学者Kristine  Wylie（未参加该项钻研）说
。